Genetisk benägenhet för svår covid-19

Bakgrund:

I Sverige är över 35 000 konstaterade smittade med SARS-CoV-2 och över 4 200 har avlidit i covid-19. Över 2 000 personer har vårdats på intensivvårdsavdelning för sjukdomen. Av de som vårdas på intensiven har många olika riskfaktorer. Noterbart är en stor könsskillnad då 3/4 av de som är så sjuka att de får intensivvård är män. Den stora skillnaden mellan könen talar starkt för att det finns genetiska faktorer som bidrar till hur allvarlig sjukdom en patient utvecklar.

Målsättning: Att identifiera genetiska faktorer som bidrar till att covid-19 får ett allvarligt förlopp Arbetsplan:

Vi kommer att rekrytera fyra grupper av personer med laboratorieverifierad infektion, i första hand personer yngre än 60 år och utan kända riskfaktorer: • patienter som intensivvårdats, • patienter som vårdats på sjukhus utan intensivvård • personer som varit ordentligt sjuka men tillfrisknat efter vård i bostaden och

• personer som inte haft några eller bara mycket lindriga symtom.

DNA isoleras och 30 personer i vardera gruppen analyseras med helgenomsekvensering (WGS). Samma blodprov kommer även att användas för antikroppsanalysen för att fastställa om det föreligger immunitet mot covid19.

Den bioinformatiska analysen av WGS kommer i första hand att inriktas på kandidatgener som ACE2 och CLEC4M, men även regioner som identifierats med GWAS-analyser. Vi kommer dessutom att analysera för andelen celler i helblod och i olika fraktioner av vita blodkroppar som uppvisar förlust av Y-kromosomen. Genom att jämföra personer i de olika grupperna försöker vi identifiera genetiska varianter som antingen bidrar till svår sjukdom eller skyddar.

Eventuella DNA-varianter associerade med sjukdomsförloppet kommer därefter att verifieras i ett större material med riktade DNA-analyser. Materialinsamling på upp till 500 personer i varje grupp planeras för denna utvidgade analys. Om vi på så sätt kan hitta riskgener för svår covid-19 kommer ett kliniskt test att utvecklas för att erbjuda klinisk anlagstestning för svår covid-19.

Betydelse:

Om man kan identifiera riskgener för svår covid-19 kommer vi att etablera kliniska tester som kan hitta känsliga individer så att de kan skyddas.

Kunskap om riskgener kan även bidra till att förklara sjukdomsförloppet för andra infektioner och därmed få en generell betydelse för att förstå infektionssjukdomar och ge nya möjligheter att utveckla vaccin och terapi mot svåra infektionssjukdomar.